目前，我國城市二次供水的方法大多是建筑地下貯水池、屋頂水箱的方式。雖解決了部分高層用水的需求和管網水壓偏低的問題，但二次供水系統污染，飲用水水質下降，各種嚴重的水質污染時有發生，大大影響了人們的身體健康，與人們生活水平提高而對水質要求越來越高的矛盾日益突出。加強對二次供水的管理，保證用戶用到符合國家水質標準的水，已是供水企業必須面臨和解決的問題。

生活飲用水的水質安全關系著居民的身體健康，因此國家衛生部門為保障生活飲用水的衛生安全，頒布了嚴格的法規來加強生活飲用水水質監測管理。各項法規對各類供水尤其是二次供水設施的水質采樣點位置、檢驗項目及監測頻率等都有明確要求。

二次供水14項檢測項目：細菌總數、砷、氟化物、硝酸鹽、色度、渾濁度、PH、溶解性總固體、總硬度、cod、鐵、錳、氯化物、硫酸鹽

二次供水21項檢測項目：色度、pH、渾濁度、臭和味、肉眼可見物、硫酸鹽、氯化物、氨氮、亞硝酸鹽氮、硝酸鹽氮、揮發酚類、耗氧量、總硬度、鐵、錳、銅、鉛、菌落總數、總大腸菌群、耐熱大腸菌群、大腸埃希氏菌

二次供水存在的水質問題主要有：

1、紅蟲和細菌等微生物

水箱(池)內的水經過較長時間的累積，積累有各種有機物，提供了紅蟲和細菌等微生物繁殖的物質基礎；池內水體停留一段時間以及對流較小，以致水中含氧不足；池內溫度適合紅蟲和細菌等微生物生長及繁殖的條件；離水廠遠端水池水余氯的消降等均為紅蟲和細菌等微生物生存提供了條件。它們常寄生在水箱的積(污)泥、粗糙的水箱(池)的表面、水管內的水垢以及藻類之中。

2、濁度及色度

二次供水中濁度及色度明顯高于管網水、出廠水，這是二次供水設施(水池及供水管道)二次污染所致。

3、濁氨氮等有機物

調查表明，管網水和二次供水中氨氮的含量分別為0.02mg/ L、0.07mg/ L，二次供水中氨氮的含量明顯高于市政供水；耗氧量、總氮二次供水也高于管網水。

二次供水設施清洗消毒時，使用過量的氯消毒劑容易造成氯消毒副產物氯仿、四氯化碳等指標超過國家標準的現象發生。